Ewch i’r prif gynnwys
Greg Ngo

Dr Greg Ngo

Cymrawd Ymchwil

Yr Ysgol Meddygaeth

Email
NgoG@caerdydd.ac.uk
Campuses
Adeilad Geneteg Canser, Ysbyty Athrofaol Cymru, Parc y Mynydd Bychan, Caerdydd, CF14 4XN
Users
Ar gael fel goruchwyliwr ôl-raddedig

Trosolwyg

DNA-RNA Hybrids a Labordy Sefydlogrwydd Genom

Mae fy ymchwil presennol yn canolbwyntio ar ddeall ffurfiad R-ddolenni, strwythurau enigmatig sy'n cynnwys croesfannau DNA-RNA, mewn seibiannau llinyn dwbl DNA, a sut mae'r broses hon yn effeithio ar sefydlogrwydd genomau a'r risg o ddatblygu anhwylderau niwroddatblygiadol fel anabledd deallusol, anhwylder sbectrwm awtistiaeth (ASD) ac anhwylder gorfywiog diffyg sylw (ADHD).

Cyhoeddiad

2022

2021

2018

2017

2015

2014

2011

2010

2009

2008

2007

2004

2003

Erthyglau

Ymchwil

Mae gen i ddiddordeb hirsefydlog mewn atgyweirio DNA a'i gyfraniad at sefydlogrwydd genomau, gan ganolbwyntio ar atgyweirio seibiannau llinyn dwbl DNA (DSBs) a telomeres camweithredol. Dros yr 20 mlynedd diwethaf, rwyf wedi datblygu arbenigedd unigryw wrth ddadansoddi canolradd/cynhyrchion atgyweirio DNA ac wedi cyfrannu at ddealltwriaeth o wahanol fecanweithiau atgyweirio DNA mewn bodau dynol ac organebau model (burum, archaea a bacteria sy'n egin).

Yn fwy diweddar, rwyf wedi dod â diddordeb yn rôl hybrid DNA-RNA mewn atgyweirio DNA, yn dilyn fy darganfyddiad bod dolenni R yn cronni yn DSBs. Ar ben hynny, darganfyddais fod dau enyn, UPF1 ac UPF3B, yn ysgogi ffurfio'r strwythurau enigmatig hyn mewn celloedd dynol. Mae intriguingly, camweithrediad yn UPF1 ac UPF3B yn gysylltiedig â risg etifeddol ar gyfer datblygu anhwylderau niwroddatblygiadol.

Fy nodau ymchwil yw sefydlu'r mecanwaith moleciwlaidd sy'n hyrwyddo ffurfio dolen R yn DSBs a deall sut mae'r strwythurau hyn yn effeithio ar sefydlogrwydd genom a datblygu anhwylderau niwroddatblygiadol. I wneud hyn, rydym yn defnyddio dull amlddisgyblaethol sy'n cyfuno geneteg, biocemeg, biowybodeg a niwrowyddorau. Ymhlith y technegau allweddol a ddefnyddiwn mae golygu genynnau CRISPR, ymhelaethu meintiol o DNA un-sownd (QAOS), gel DNA 2-dimensiwn, dadansoddiad amplicon PCR moleciwl sengl, dilyniannu'r genhedlaeth nesaf (NGS), dilyniannu nanopore hir-ddarllen,  mapio DSB (INDUCE-seq) a thechnolegau bôn-gelloedd pluripotent a ysgogwyd.

Bywgraffiad

Dechreuais ymddiddori mewn sefydlogrwydd genomau pan oeddwn yn cymryd rhan, fel myfyriwr prosiect israddedig, mewn astudio mwtanau atgyweirio DNA yn E.coli (labordy yr Athro Robert Lloyd, Prifysgol Nottingham). Fel cynorthwyydd ymchwil i Dr. Thorsten Allers (Prifysgol Nottingham), gweithiais wedyn ar yr archaeon H.volcanii, lle cynorthwyais i ddatblygu offer genetig i astudio ailgyfuniad homologous (AD).

Yn ystod fy astudiaeth D.Phil. gyda'r Athro Ian Hickson (Prifysgol Rhydychen), fe wnes i nodweddu genynnau sy'n rhyngweithio'n enetig â'r Helas Blodau (Sgs1) mewn burum newydd, a llwyddo i adnabod Esc2 fel ffactor newydd sy'n ofynnol ar gyfer AD mewn ffyrc dyblygu stondin.

Yn dilyn fy astudiaeth D.Phil, ymunais â labordy'r Athro David Lydall (Prifysgol Newcastle) i ymchwilio i fecanwaith atgyweirio DNA mewn telomerau heb eu capio mewn burum newydd. Rhoddodd fy ngwaith fewnwelediadau newydd i rôl bwysig ail-dorri DNA mewn senescence cellog a datgelodd fod y broses hon wedi'i thiwnio'n fân gan wahanol broteinau gwirio difrod DNA.

Yna ymunais â labordy'r Athro Duncan Baird (Prifysgol Caerdydd) i weithio ar atgyweirio DNA telomerig mewn celloedd dynol. Dangosais fod atalyddion PARP yn dileu celloedd yn ddetholus yn ystod argyfwng telomere, gan atal anfarwoli celloedd. Mae'r astudiaeth brawf cysyniad hon yn dangos y gellid manteisio ar 'lethality telomerig' i atal dilyniant canser. Yn ddiweddar, llwyddais i ganfod dolenni R yn uniongyrchol yn DSBs am y tro cyntaf a dangos bod y strwythurau hyn yn cael eu cynhyrchu gan UPF1 i ysgogi atgyweirio DNA.

Yn 2023, dyfarnwyd Gwobr Datblygu Gyrfa Ymddiriedolaeth Wellcome i mi ymchwilio i rolau R-dolenni a mwtaniadau ym pathogenesis anhwylderau niwroddatblygiadol.

Meysydd goruchwyliaeth

Mae gen i ddiddordeb mewn goruchwylio myfyrwyr PhD ym meysydd:

  • Sefydlogrwydd genom
  • Atgyweirio DNA
  • Anhwylderau niwroddatblygiadol

Goruchwyliaeth gyfredol

Angelos Damo

Angelos Damo

Myfyriwr ymchwil