Dr Maëliss Jallais

(hi/ei)

Cyhoeddiad

• Date
• Type

Ymchwil

Mae fy ymchwil yn canolbwyntio ar wella dibynadwyedd a dehongladwy biofarcwyr sy'n deillio o MRI ar gyfer niwrowyddoniaeth a chymwysiadau clinigol. Rwy'n arbenigo mewn casgliad Bayesian, ynghyd â dysgu peiriannau (ML) ac MRI trylediad. Mae fy ngwaith yn mynd i'r afael â her ganolog mewn niwroddelweddu: sut i gael priodweddau meinwe dibynadwy, dehongladwy a chlinigol ddefnyddiol o fesuriadau anuniongyrchol, swnllyd, gan alluogi casgliadau gwyddonol cadarn a biofarcwyr clinigol ddibynadwy. 

Cyfraniadau gwyddonol allweddol:

• Cyflwyno casgliad seiliedig ar efelychiad (SBI) ar gyfer dMRI:
  • Cyflwynais, fel awdur cyntaf, y defnydd o SBI, techneg casgliad Bayesian, i amcangyfrif dosbarthiadau tebygolrwydd paramedrau meinwe mewn dMRI.
  • Cyfraniad personol: Arwain y datblygiad a'r gweithredu methodolegol.
  • Pam mae'n bwysig: Mae'r dull hwn yn symud y tu hwnt i amcangyfrifon pwynt traddodiadol, gan alluogi nodweddu microstrwythur yr ymennydd yn fwy cadarn ac addysgiadol.
• Datblygu μGUIDE: fframwaith Bayesian cyflym ar gyfer meintioli ansicrwydd:
  • Datblygais μGUIDE, fframwaith AI Bayesian newydd ar gyfer amcangyfrif dosbarthiadau posterior voxel-wise mewn qMRI a'i ryddhau fel meddalwedd ffynhonnell agored.
  • Cyfraniad personol: Dyluniwyd y dull, arweiniodd ddilysu, a gweithredu'r feddalwedd.
  • Pam mae'n bwysig: Mae μGUIDE yn mynd i'r afael â bwlch hirsefydlog yn y maes trwy ddarparu amcangyfrifon ansicrwydd y gellir eu dehongli a chanfod dirywion model, gwella atgynhyrchadwyedd a galluogi defnydd mwy dibynadwy o biofarcwyr delweddu mewn lleoliadau ymchwil a chlinigol. Mae'n cyflawni cyflymiad ~1500 gwaith dros ddulliau traddodiadol (e.e. MCMC), heb gyfyngiadau caffael na chaledwedd drud, gan oresgyn rhwystr mawr i ddefnydd ymarferol casgliad Bayesian mewn MRI.
• Datblygiadau mewn modelu ymwybodol o ansicrwydd o ficrostrwythur yr ymennydd:
  • Fe wnes i gymhwyso μGUIDE i fodelau bioffisegol a gynigiwyd yn ddiweddar sy'n ymgorffori athreiddedd celloedd.
  • Cyfraniad personol: Arweiniodd y cymhwyso a'r dadansoddiad methodolegol gan ddefnyddio μGUIDE.
  • Pam mae'n bwysig: Mae'r gwaith hwn yn dangos y gellir defnyddio ansicrwydd i nodi a hidlo amcangyfrifon annibynadwy a llywio dylunio arbrofol, gan dynnu sylw at bwysigrwydd dadansoddiad sy'n ymwybodol o ansicrwydd mewn delweddu niwrowyddoniaeth.
• Gwell amcangyfrif dwysedd asgwrn cefn dendritig gan ddefnyddio sbectrosgopeg MR wedi'i bwysoli trylediad:
  • Dangosais fod cyfuno caffaeliadau sbectrosgopeg MR sy'n amgodio trylediad sengl a dwbl yn gwella sensitifrwydd i ddwysedd asgwrn cefn dendritig, gan ddefnyddio modelu cyfrifiadurol uwch o ledaeniad metabolit.
  • Cyfraniad personol: Arweiniodd ddyluniad yr astudiaeth ac integreiddio efelychiadau Monte Carlo mewn efeilliaid digidol niwronau realistig, optimeiddio dilyniant, a modelu tebygolrwydd ar gyfer dadansoddi signalau.
  • Pam mae'n bwysig: Mae'r gwaith hwn yn dangos y gall integreiddio modelu cyfrifiadurol â dylunio caffael ddatgelu llofnodion mesuradwy o nodweddion cellog cymhleth, gan ddarparu fframwaith cyffredinol ar gyfer datblygu protocolau niwrodelweddu mwy gwybodus.   
• Modelu Bayesian hierarchaidd ar gyfer gwell dibynadwyedd biofarcwyr:
  • Fe wnes i gyd-ddatblygu hierarchical-μGUIDE, fframwaith sy'n trosoli gwybodaeth a rennir ar draws voxels i leihau ansicrwydd a dirywiad voxel-wise, tra'n dysgu parseliad ymennydd tebygol ar y cyd.
  • Cyfraniad personol: Cyd-ddatblygu'r fethodoleg, goruchwylio'r myfyriwr PhD awdur cyntaf, a chyfrannu at weithredu a gwerthuso.
  • Pam mae'n bwysig: Mae'r dull hwn yn lleihau ansicrwydd hyd at 80%, gan alluogi amcangyfrif paramedrau mwy sefydlog wrth ddysgu parseliad tebygolrwydd seiliedig ar ficrostrwythur, heb fod angen cofrestru.
• Mynd i'r afael ag anghysondeb sŵn mewn ML dan oruchwyliaeth ar gyfer dMRI:
  • I shown that supervised ML models trained on simulated dMRI data can produce biased and misleading microstructure estimates due to mismatches between simulated and real noise distributions (covariate shift) and proposed a realistic noise synthesis strategy to correct this issue.
  • Cyfraniad personol: Cyd-ddylunio'r astudiaeth, nodi ffynhonnell rhagfarn, a datblygu'r datrysiad methodolegol a'r fframwaith dilysu.
  • Pam mae'n bwysig: Mae'r gwaith hwn yn nodi diffyg sylfaenol yn y ffordd y mae ML dan oruchwyliaeth yn cael ei gymhwyso i dMRI ar hyn o bryd ac yn darparu ateb egwyddorol i adfer dibynadwyedd.

Grantiau:

• Prosiectau cydweithredol partneriaeth ffiseg Affrica-DU UKRI STFC 2025. Datblygu technoleg efeilliaid digidol yr ymennydd dan arweiniad ffiseg gan ddefnyddio MRI ac EEG cost isel yn Affrica Is-Sahara. Rôl: Cydweithredwr ar y prosiect dan arweiniad yr Athro Wheeler-Kingshott. Ebrill 2026 – Ebrill 2028.
• NMHII Arweinwyr y Dyfodol mewn Cyllid Cynhadledd Ymchwil. Cyllid y gynhadledd ar gyfer mynychu cynhadledd flynyddol ISMRM yn Cape Town (De Affrica) (£1000). 2026.
• Gwarantwyr yr Ymennydd. Gwobr Teithio am fynychu Gweithdy ISMRM ar 40 Mlynedd o Ledaeniad: Safbwyntiau'r Gorffennol, y Presennol a'r Dyfodol yn Kyoto (Japan) (£1200). 2025.
• Gwobr Symudedd Ymchwil Taith. Amcangyfrif ffracsiwn signal axonal a meintioli ansicrwydd gan ddefnyddio μGUIDE mewn data MRI trylediad cyn-glinigol a chlinigol. £1800 ar gyfer ymweliad ymchwil myfyriwr PhD o Brifysgol Dechnegol Denmarc (Thina Lundsgaard Thogersen, wedi'i gyd-oruchwylio gan Dr Pizzolato a'r Athro Dyrby) am 3 wythnos yn CUBRIC. 2025.
• SFRMBM a FLI. Grant teithio ar gyfer mynychu'r gynhadledd ESMRMB gwyddonol flynyddol yn Barcelona (Sbaen) (500 €). 2024.
• SFRMBM a FLI. Grant teithio ar gyfer mynychu cynhadledd flynyddol ISMRM yn Singapore (500 €). 2024.
• Gwarantwyr yr Ymennydd. Gwobr Teithio am fynychu cynhadledd flynyddol ISMRM yn Toronto (Canada) (£1000). 2023.
• SFRMBM a FLI. Grant teithio ar gyfer mynychu cynhadledd flynyddol ISMRM yn Toronto (Canada) (500 €). 2023.

Addysgu

• Cynorthwyydd sesiwn ymarferol ar gyfer y dosbarth Dysgu Peirianyddol (9h, 2021); ENSAE (Ffrainc), lefel Meistr.
• Cynorthwyydd sesiwn ymarferol ar gyfer prosiect peirianneg meddalwedd (40h, 2021); Prifysgol Paris-Sud (Ffrainc), myfyrwyr Trwydded 3ydd flwyddyn.

Bywgraffiad

Addysg

• 2022: PhD. Inria Saclay, CEA Neurospin, Université Paris Saclay (Saclay, Ffrainc), o dan oruchwyliaeth Dr Demian Wassermann. Teitl y traethawd hir: Galluogi sensitifrwydd celloedd cortical penodol ar fesuriadau microstrwythur MRI trylediad gan ddefnyddio casgliad di-debygolrwydd.
• 2018: Diploma Peirianneg. CPE Lyon (Lyon, Ffrainc). Mawr: Dadansoddi Delweddau, Modelu a Chyfrifiadureg.
• 2018: Ymchwil MSc. Université Lyon 1 (gradd ddwbl gyda CPE Lyon). Delwedd, Datblygu a Thechnolegau 3D.

Cyflogaeth

• Gorffennaf 2025 - presennol: Swydd ôl-ddoethurol yng Nghanolfan Delweddu Ymchwil yr Ymennydd Prifysgol Caerdydd
  (CUBRIC), Caerdydd, DU
  • Pwnc ymchwil: AI Gwyrdd ar gyfer Delweddu Meddygol Cyflym (GAIA)
  • Goruchwylydd: Dr Marco Palombo.
• Mehefin 2022 - Mehefin 2025: Swydd ôl-ddoethurol yng Nghanolfan Delweddu Ymchwil yr Ymennydd Prifysgol Caerdydd
  (CUBRIC), Caerdydd, DU
  • Pwnc ymchwil: Delweddu microstrwythur trwy MRI trylediad, modelu cyfrifiadurol a
    Dysgu peirianyddol
  • Goruchwylydd: Dr Marco Palombo
  • Mewn cydweithrediad â'r Ganolfan Delweddu Ymchwil Moleciwlaidd (MIRCen) yn CEA Fontenay-
    aux-Roses, Ffrainc.
• Chwefror 2019 - Chwefror 2022: Rhaglen PhD yn Inria a CEA Neurospin, Tîm Parietal, Paris, Ffrainc
  • Pwnc ymchwil: Galluogi sensitifrwydd cell-benodol cortical ar microstrwythur MRI trylediad
    mesuriadau gan ddefnyddio casgliad di-debygolrwydd
  • Goruchwylydd: Dr Demian Wassermann
  • Prifysgol: Université Paris-Saclay
  • Dyddiad amddiffyn: 16/02/2022
  • Traethawd PhD
• Chwefror 2018 - Gorffennaf 2018: Interniaeth diwedd astudio, GE Healthcare, Buc, Ffrainc
  • Pwnc ymchwil: Dadansoddi llif delwedd a segmentu mewn gweithdrefn ymyrraeth
  • Goruchwylydd: Dr Régis Vaillant
• Gorffennaf 2016 - Mehefin 2017: Interniaeth flwyddyn, Tîm dadansoddi a delweddu delweddau meddygol, Kitware, Carrboro, Gogledd Carolina, UDA
  • Prif ddatblygwr system ailadeiladu golygfeydd 3D ac olrhain gwrthrychau yn C ++
  • Goruchwylydd: Dr Stephen Aylward
  • AnatomicAugmentedRealityProjector: Uwchsain Augmentation: Sganio 3D cyflym ar gyfer olrhain ac arddangos ar y corff yn C ++ gan ddefnyddio CMake.

Ymgysylltu Cenedlaethol a Rhyngwladol

• Cyd-drefnydd gweithdy cyn-gyngres ESMRMB ar Ddelweddu Microstrwythur yn Girona (Sbaen) a gynhelir ym mis Hydref 2026.
• Cyd-drefnydd y sesiynau Sgiliau Trosglwyddadwy yng Nghyfarfod Blynyddol ISMRM 2026 yn Cape Town (De Affrica) a gynhelir ym mis Mai 2026: Cynllunio a chydlynu (tîm 4 person) rhaglen chwe sesiwn sy'n cynnwys arbenigwyr blaenllaw gwahoddedig ar draws y byd academaidd a diwydiant.
• Cyd-drefnydd (gyda thri chymrawd iau) y sesiwn "From Method to Medicine: Bridging Impact Factor and Real-World Impact" yng Nghyfarfod Blynyddol ISMRM 2026 yn Cape Town (De Affrica) a gynhelir ym mis Mai 2026: Arweiniodd ddatblygu a chyflwyno sesiwn â ffocws gydag arbenigwyr gwahoddedig.
• Cadeirydd a threfnydd y Cyfarfodydd MicroFfiseg yn CUBRIC (2024 -nawr): Cyfarfodydd wythnosol gan gynnwys tîm o 40 o bobl sy'n gweithio ar ddelweddu microstrwythur yn CUBRIC.
• Trefnydd Hacathon Cyfrifiadura Gweledol ym Mhrifysgol Caerdydd ym mis Mehefin 2024 (digwyddiad tri diwrnod).
• Cadeirydd a threfnydd y Cyfarfodydd Sesiwn Sgiliau yn CUBRIC (2022-2023) gyda siaradwyr gwadd.
• Cynllunydd a threfnydd CUBRIC MicroTeam Retreat ym mis Mai 2023 (digwyddiad tri diwrnod).
• Cadeirydd a threfnydd Cynhadledd Canolfan CUBRIC ym mis Ionawr 2023, sy'n cynnwys 100 o ymchwilwyr.

Anrhydeddau a dyfarniadau

Gwobrau:

• Cymrawd Iau ISMRM, 2025: Rhaglen a sefydlwyd i gydnabod ymchwilwyr a chlinigwyr rhagorol ar gam cynnar yn eu gyrfaoedd, gydag ymrwymiad sefydledig a hirdymor i ISMRM.
• Gwobr John Griffiths ar gyfer MR Cyn-glinigol, 2025: Ail wobr ym Mhennod Prydain ac Iwerddon o ISMRM.
• Enillydd cystadleuaeth ISMRM Shark Tank, 2024: Cystadleuaeth entrepreneuraidd ryngwladol gan gynnwys ffug gyfweliadau ar gyfer perswadio buddsoddwyr i fuddsoddi mewn cwmni newydd damcaniaethol yn seiliedig ar syniadau arloesol, gyda phanel beirniaid arbenigol.
• Gwobr Teilyngdod ISMRM Magna Cum Laude, 2024: Gwobr aelod dan hyfforddiant am grynodeb sydd wedi'i restru yn y 15% uchaf yn y categori MRI Trylediad.
• Gwobr Arloesi Ymchwil Mansfield, 2024: Dyfarnwyd £1500 gan Bennod Prydain ac Iwerddon o ISMRM a Siemens i fynychu cynhadledd flynyddol ISMRM yn Singapore.
• Gwobr Teilyngdod ISMRM Summa Cum Laude, 2023: Gwobr aelod dan hyfforddiant am grynodeb sydd wedi'i restru yn y 5% uchaf yn y categori MRI Trylediad.
• Gwobr Teilyngdod ISMRM Magna Cum Laude, 2021: Gwobr aelod dan hyfforddiant am grynodeb sydd wedi'i restru yn y 15% uchaf yn y categori MRI Trylediad.

Sgyrsiau gwahoddedig: 

• Sgwrs wahoddedig ym Mhennod Prydain ac Iwerddon o Gyfres Addysg MR ISMRM, Mawrth 2026, ar-lein. Teitl: MRI Niwro Perfformiad Uchel: Mewnwelediadau i Microstrwythur Mater Llwyd.
• Sgwrs wahoddedig yng ngweithdy ESMRMB Precongress ar Ddelweddu Microstrwythurol, Hydref 2025, Marseille (Ffrainc). Teitl: Dulliau AI sy'n dod i'r amlwg ar gyfer Amcangyfrif Paramedr Microstrwythur mewn MRI Trylediad.
• Prif gyflwyniad yng ngweithdy DIPY (Diffusion Imaging in PYthon), Mawrth 2025 (rhifyn ar-lein). Teitl: Casgliad Bayesian Cyflym a Chadarn Seiliedig ar Efelychu gydag AI.
• Sgwrs wahoddedig yng ngweithdy Microstructure Imaging meets Machine Learning (MIML), Medi 2023, Caerdydd (DU). Teitl: Casgliad Bayesian Cyflym a Chadarn Heb Debygolrwydd gyda Dysgu Peiriannau.

Ymrwymiadau siarad cyhoeddus

• Gwirfoddoli yn y Rendez-vous des Jeunes Mathématiciennes et Informaticiennes, a drefnwyd gan Inria Saclay ac Animaths yn 2020 a 2021: Digwyddiadau deuddydd sy'n anelu at annog myfyrwyr ysgol uwchradd benywaidd i ddilyn astudiaethau gwyddonol.

Pwyllgorau ac adolygu

• Adolygydd rheolaidd ar gyfer cyfnodolion sy'n canolbwyntio ar ymchwil:
  • Gwyddoniaeth Uwch
  • Dadansoddi Delweddau Meddygol (MEDIA)
  • Cyseiniant Magnetig mewn Meddygaeth
  • Niwrowyddoniaeth Delweddu
  • Mapio Ymennydd Dynol
  • NiwroDdelwedd
• Adolygydd ar gyfer cynhadledd flynyddol ISMRM ers 2023
• Adolygydd ar gyfer myfyriwr MSc blwyddyn olaf yn 2024 ym Mhrifysgol Rennes (Ffrainc).

Meysydd goruchwyliaeth

Myfyrwyr PhD:

• Gerasimos Katsagannis - gyda Dr Palombo, Dr. Kopanoglu a'r Athro Cercignani; Hydref 2025-presennol.

Myfyrwyr sy'n ymweld:

• Myfyriwr MSc gwadd o Brifysgol Utrecht (Paula Del Popolo); Chwefror-Gorffennaf 2025.
• Myfyriwr PhD gwadd o Brifysgol Dechnegol Denmarc (Thina Lundsgaard Thøgersen, dan oruchwyliaeth Dr Marco Pizzolato a'r Athro Tim Dyrby); Ionawr 2025.

Prosiect grŵp MSc:

• Prosiect MSc Cyfrifiadureg (5 myfyriwr); 2026.

Goruchwyliaeth gyfredol

Gerasimos Katsagannis