Dr Katerina Kaouri

Cyhoeddiad

• Date
• Type

Ymchwil

Diddordebau Ymchwil

Modelu penderfynol a stochastig mewn bioleg, peirianneg, a ffiseg, busnes a chymdeithas. Ffocws: Bioleg Fathemategol a Chyfrifiannol (modelau trosglwyddo firaol awyr, ffrwythloni ac embryogenesis, signalau calsiwm, cyplu mecanocemegol). Hefyd: Mecaneg hylif; Mathemateg Ddiwydiannol; Dulliau symptotig.

Prosiectau Bioleg Fathemategol / Cyfrifiannol:

• Modelau mecanocemegol o signalau calsiwm mewngellol a rhynggellog, sy'n ystyried cyplu calsiwm i ymddygiad mecanyddol y celloedd a'r meinwe. Mae'r cyplu mecanocemegol hwn yn chwarae rhan hanfodol mewn llawer o brosesau a chlefydau'r corff, er enghraifft embryogenesis, gwella clwyfau, atherosglerosis a chanser. Cydweithredwyr: Yr Athro Philip Maini (Prifysgol Rhydychen) Yr Athro Jon Chapman (Prifysgol Rhydychen), Dr Paris Skourides a Dr Neophytos Christodoulou (Prifysgol Cyprus, Biowyddorau), Dr Ricardo Ruiz-Baier (Prifysgol Monash), Yr Athro Lance Davidson (labordy MechMorpho, Prifysgol Pittsburgh). Gweler papur diweddar. Myfyriwr PhD: Chakraborty bhishek
• Signalau calsiwm mewn ffrwythloni (protocolau IVF gorau posibl). Rydym yn modelu ac yn efelychu signalau calsiwm yn llygoden ac mewn wyau dynol er mwyn egluro amodau ffrwythloni In-Vitro llwyddiannus (IVF).   Dangoswyd mewn arbrofion diweddar bod osgled ac amlder osgiliadau calsiwm yn cydberthyn yn uniongyrchol â llwyddiant ffrwythloni ac rydym yn adeiladu'r model cysylltiedig cyntaf. Ar y cyd â'r Athro Karl Swann, Cadeirydd Bioleg Atgenhedlol (Biowyddorau Caerdydd) a Dr Thomas Woolley (Caerdydd). Myfyrwyr: Layla Namaghi Sadeghi (MPhil, wedi'i gwblhau), Bryony Bennett, Luke Heirene, Oliver Griffiths (MMath, wedi'i gwblhau)
• Dadansoddi data a modelu cyfrifiadurol o gyfradd twf embryo a metrigau llwyddiant eraill yn IVF (mewn cydweithrediad â Chlinig Menywod Llundain). Ffactor allweddol ar gyfer llwyddiant yn ystod cylch ffrwythloni in vitro (IVF) yw dewis embryo. Mae hyn yn golygu rhagweld pa embryo sydd fwyaf tebygol o roi beichiogrwydd hyfyw. Mae dulliau cyfredol fel delweddu treigl amser o gylchoedd celloedd, neu broffilio metabolig, yn y drefn honno heb eu profi neu'n anodd eu gweithredu. Rydym yn canolbwyntio ar embryonau sydd wedi'u cadw'n cryogenig, sy'n cael eu cynhesu a'u disodli i'r groth ar ôl cael eu hasesu gan yr embryolegydd i gael cyfle da ar gyfer beichiogrwydd.   Mae gan LWC symiau mawr o ddata ynghylch pentyrrau delwedd treigl amser o gelloedd cyn trosglwyddo embryo. Mae'r embryolegwyr wedi'u hyfforddi'n fawr i ddehongli'r dilyniannau delwedd hyn ond mae hyfforddi personél i safonau o'r fath yn broses araf. Hefyd, nid yw'r metrigau i asesu llwyddiant posibl yn glir. Rydym yn datblygu meddalwedd segmentu delwedd soffistigedig, hawdd ei ddefnyddio a fydd ar yr un pryd yn tynnu nodweddion lluosog embryo dadmer a nodi'r metrigau gorau ar gyfer llwyddiant embryo. Mewn cydweithrediad â: Dr Thomas Woolley (Caerdydd), Helen Priddle (LWC) a Giles Palmer. Myfyriwr PhD: Tim Ostler
• Signalau calsiwm mewn canser: Yn ddiweddar, dangoswyd bod signalau calsiwm yn chwarae rhan sylweddol yn esblygiad canser. Rydym yn datblygu modelau penderfynol gofodol, wedi'u llywio gan arbrofion ac yn ymchwilio i rôl signalau calsiwm mewn canser, gyda'r nod o lywio therapïau newydd. Mewn cydweithrediad â: Dr Ruediger Thul (Nottingham). Dr Andreas Buttenschön (Prifysgol British Columbia) a Dr Vasiliki Bitsouni. Gweler y rhagargraffiad yn yr arxiv.
• Modelu stochastig o intrsignalaucalsiwm cellog. Calsiwm yw ail negesydd hollbresennol sy'n cyfathrebu gwybodaeth bwysig ar draws y gell. Mae sŵn yn chwarae rhan hanfodol yn y trosglwyddo gwybodaeth ac mae llawer o gwestiynau yn dal ar agor. Ar hyn o bryd rwy'n gweithio ar ddau brosiect:
  • Cymhariaeth o ddau fodel penderfynol a stochastig ar gyfer osgiliadau calsiwm. Mewn cydweithrediad â Dr Thomas Woolley. Myfyriwr MMath: Ali Tariq 
  • Dadgodio signalau calsiwm swnllyd gan broteinau, mewn cydweithrediad â Dr Ruediger Thul (Prifysgol Nottingham). Myfyriwr ymchwil sy'n ymweld: Anastasios Koulogiannis
• Targedu magnetig: Mewn targedu magnetig mae cyffuriau ynghlwm wrth ronynnau magnetig ac fe'u cyfeirir at ran benodol o'r corff dynol gan ddefnyddio maes magnetig. Rydym yn modelu gwahanol senarios ac yn perfformio efelychiadau o lif gwaed a symudiad gronynnau. Rydym hefyd yn y gwaed yn hylif nad yw'n Newtonaidd. Gyda: Yr Athro Tim Phillips (Caerdydd), Claudia Fanelli a'r Athro Tim Myers (CRM, Barcelona).

Cysylltwch â mi os oes gennych ddiddordeb mewn gweithio ar unrhyw un o'r heriau uchod.

Prosiectau ymchwil eraill:

Rwyf wedi bod yn gweithio ar amryw o brosiectau dros y blynyddoedd. Mae rhai prosiectau allweddol yn cael eu hamlygu isod:

• Modelu ffyniant sonig: Yn fy ymchwil DPhil (Prifysgol Rhydychen) rwyf wedi datblygu modelau mathemategol o ffyniant sonig a gynhyrchir gan awyrennau uwchsonig, fel aelod o SOBER, Rhaglen Ymchwil Ewropeaidd Sonic Boom. Roedd SOBER yn gonsortiwm aml-brifysgol, y byd academaidd-diwydiant, a gydlynir gan AIRBUS. Mae ymchwil ffyniant sonig yn dal i fod yn faes ymchwil poeth gan nad oedd unrhyw gludwr uwchsonig sifil yn hedfan eto ar ôl i Concorde ddod i ben. Gweler fy narlith DPhil a phapurau cysylltiedig yma, yma ac yma.
• Rheoli adnoddau dŵr: Rwy'ncyd-destun y Grŵp Astudio 1af gyda Diwydiant buom yn cydweithio ag Adran Datblygu Dŵr Cyprus, y sefydliad llywodraethol sy'n rheoli adnoddau dŵr. Ynghyd â thîm rhyngwladol o fodelwyr (Raka Mondal, Graham Benham, Sourav Mondal ac eraill) gwnaethom fodelu'r dŵr i mewn ac allan o'r dyfrhaen Germasogeia a chynnig protocol ail-wefru gorau posibl.   Darllenwch ein papur yma.
• Modelu hyperthermia magnetig: mae hyperthermia magnetig yn therapi canser minimally ymledol, lle mae magnet allanol yn tywys nanoronynnau magnetig trwy'r llif gwaed i gyrraedd tiwmor. Yna mae'r tiwmor yn cael ei losgi trwy godi ei dymheredd, tra bod celloedd iach yn parhau, yn ddelfrydol, heb eu heffeithio. Mae modelu canser yn faes gweithredol iawn o fioleg feintiol. Gweler y papur perthnasol yma.
• Llif hylif mewn ffibrau optegol: Gyda Dr Paul Christodoulides ym Mhrifysgol Technoleg  Cyprus (CUT) rydym wedi cyd-oruchwylio myfyriwr MSc ar y prosiect hwn (2018). Ein nod yw cysylltu'r modelau datblygedig i arbrofion ar ffibrau optegol yn y labordy Kallis (CUT). Gweler y haniaethol yma.

Ymgynghori Busnes: O 2007-2010 wedi gweithio y tu allan i'r byd academaidd fel ymgynghorydd busnes. Yn y  Boston Consulting Group, gwnaethom gynghori cwmnïau mawr, ar lefel Prif Swyddog Gweithredol, ar faterion strategol a gweithredol. Fel ymgynghorydd trosglwyddo technoleg yn rhwydwaith HELP-FORWARD (Rhwydwaith Menter Ewrop) cysylltais BBaChau ledled Ewrop ac ymchwilwyr â chwmnïau.

Gweithgareddau diwydiant-academia: Rhwng 2015-19 roeddwn yn aelod o Bwyllgor Rheoli y Rhwydwaith Mathemateg ar gyfer Diwydiant (MI-NET, COST Action TD1409), a ariannwyd gan yr UE o 32 o aelodau gwlad a hyrwyddodd y defnydd o fathemateg ar gyfer datrys heriau diwydiannol a chymdeithasol. Roeddwn hefyd yn arweinydd Gweithgor "Astudiaethau Achos" MI-NET. Fe wnaethon ni gasglu a golygu 21 o astudiaethau achos llwyddiannus o bob rhan o Ewrop. Gallwch ddarllen y llyfryn yma.

Yn 2016 arweiniais sefydliad y Grŵp Astudio 1af gyda Diwydiant yng Nghyprus, gweithdy diwydiant academia lle datrysodd arbenigwyr modelu mathemategol o 17 gwlad bedair her ddiwydiannol Cyprus, yn amrywio o wella llwybrau bysiau yn Nicosia i gynyddu ffactor arloesi teganau ENGINO. Dilynwyd y gweithdy 5 diwrnod hwn gan weithdy diwydiant academia hanner diwrnod ym mis Hydref 2017. Cynhaliwyd yr ail Grŵp Astudio gyda Diwydiant yng Nghyprus ym mis Rhagfyr 2018 ac roedd hefyd yn ddigwyddiad cyd-greu gyda chymdeithas.  Gweithiodd 37 o ymchwilwyr o 10 gwlad ar dair her gymdeithasol.

Gweithgareddau cyfathrebu gwyddonol: Rwy'n angerddol dros rannu mathemateg a gwyddoniaeth gyda phawb ac rwyf wedi bod yn rhan o weithgareddau cyfathrebu gwyddoniaeth amrywiol ers dros ddegawd. Ar wahân i fod yn gyd-sylfaenydd Gŵyl Wyddoniaeth Môr y Canoldir a'r sefydliad dielw SciCo Cyprus rwyf wedi rhoi sawl sgwrs boblogaidd i ystod eang o gynulleidfaoedd, gan gynnwys sgwrs TEDx. Mae fideos commmunication gwyddoniaeth wedi fy swyno ac rwyf wedi gweithio ar yr animeiddiad TED-Ed hwn ar ffyniant sonig (2.8  + miliwn o olygfeydd).

Ymrwymiadau siarad diweddar ac sydd ar ddod

• (Sgwrs gwahoddedig) "Amrywiaeth a chynhwysiant yn oes AI", Cynhadledd "Diwydiant 4.0: Arloesi, Deallusrwydd Artiffisial a Chynhwysiant", a drefnir gan Senedd Cyprus
• Cynhadledd ICIAM 2019, Valencia, Sbaen, 15-19 Gorffennaf 2019 (cyd-drefnydd minisymposiwm)
• (Sgwrs gwahoddedig) OCIAM @ 30 mlynedd (Dathlu etifeddiaeth Joe Keller), Sefydliad Mathemategol, Prifysgol Rhydychen. Mae cofrestru bellach ar agor, 24-25 Mehefin 2019
• (Sgwrs gwahoddedig) Sesiwn lledaenu terfynol y minisymposiwm Mathematics for Industry Network/BAMC, 25 Ebr 2019 (cyd-drefnydd minisymposiwm)
• Sgwrs a thrafodaeth banel yn Fforwm Gwyddoniaeth Agored Ewrop, 12Gorffennaf 2018 (trefnydd y sesiwn)

Addysgu

M0332 - Fluid Mechanics

Bywgraffiad

Work experience

• Lecturer in Applied Mathematics, School of Mathematics, Cardiff University, UK (2018-)
• Co-Founder and Director of the non-profit SciCo Cyprus, Cyprus (2015-)
• Research Fellow, Department of Electrical Engineering, Computer Engineering and Informatics, Cyprus University of Technology, Cyprus (2016-2017)
• Expert Scientist, Cyprus University of Technology, Cyprus (2015-17)
• Assistant Professor, Intercollege Limassol (2010-2015)
• Strategy and business consultant (2007-2010) (Boston Consulting Group, HELP-FORWARD Network)
• Postdoctoral Research Fellow, Centre for Mathematical Medicine and Biology, Nottingham University (2005-2007)
• Postdoctoral Research Fellow, Oxford Centre for Industrial and Applied Mathematics & Wolfson Centre for Mathematical Biology, Oxford University (2004-2005)

Education

• DPhil in Applied Mathematics, University of Oxford (fully funded by the Sonic Boom European Research Programme)
• MSc in Mathematical Modelling and Scientific Computing, Oxford University (top Distinction)
• MS in Applied Physics, Columbia University (fully funded by a university award)
• BA in Pure and Applied Mathematics, University of Cambridge (full-cost Cambridge Commonwealth Scholarship)

Grants and awards

• SciShops.eu, H2020 project (RIA, Science with and for Society) -101K Euros (Role: Project leader, SciCo Cyprus). Total EU budget: 3 million. 18 partners in 12 countries. Identification and solution of 250 societal challenges across Europe through community-based research
• Awards and sponsorships for the organisation of the 1st Study Group with Industry in Cyprus (2016)-37K. (Role: Principal applicant) Funding bodies: Mathematics for Industry Network (major contributor), KPMG Cyprus (major sponsor), Cyprus University of Technology, University of Cyprus, Research Promotion Foundation, Cyprus Tourism Organisation, British High Commission in Cyprus
• Award for the organisation of the industry-academia workshop in Cyprus (2017) - 1500 Euros (Role: Principal applicant) Funding bodies: Mathematics for Industry Network, British High Commission in Cyprus, Cyprus Chamber of Commerce and Industry
• Several awards for international research visits ~10K Euros Funding bodies: Mathematics for Industry Network (3 Short-Term Scientific Missions to Oxford University), ERASMUS+, Cyprus University of Technology
• Fund-raising for the organisation of the Mediterranean Science Festival - ~50K Euros (Role: MSF Co-founder and co-director)
• Scholarships for academic excellence throughout the course of studies - ~150K Euros Funding bodies: Cambridge Commonwealth Trust (BA studies), Columbia University (MSc studies), Alan Tayler Bursary, Oxford University (MSc studies). Somerville College, Oxford University (DPhil studies). Leventis Foundation (DPhil studies)

Anrhydeddau a dyfarniadau

Member of the Technical Advisory Group of the Welsh government (Environmental subgroup), advising the government on the pandemic

Judge for Famelab (science communication competition) at the 2019 semi-finals (invited by British Council)

Pwyllgorau ac adolygu

Member of the Impact Acceleration Committee of Cardiff University

Meysydd goruchwyliaeth

Mae gen i ddiddordeb mewn goruchwylio myfyrwyr PhD a myfyrwyr ôl-ddoethurol ac mewn cynnal gwyddonwyr gwadd ym meysydd:

• Bioleg Fathemategol a Chyfrifiannol (yn benodol, signalau calsiwm mewn ffrwythloni ac embryogenesis)
• Mecaneg Hylif (yn benodol, targedu magnetig ar gyfer cymwysiadau bio a heriau biohylifau eraill)
• Mathemateg ddiwydiannol (heriau busnes a chymdeithasol y gellir mynd i'r afael â modelu ac efelychu mathemategol)

Mae myfyrwyr ymchwil PhD ac MPhil i'w gweld isod.

PDRAs blaenorol:

Dr Attila Kovaks (ar hyn o bryd ym Mhrifysgol Rhydychen)

Dr Raquel Gonzalez Farina (Uwch Ddadansoddwr Meintiol, Grŵp Macquarie, Awstralia)

Dr Alexander Pretty(sydd ar hyn o bryd ym Mhrifysgol Caerdydd fel Cymrawd Addysgu)

Dr Aaron Saesneg (ar hyn o bryd ym Mhrifysgol Parma)

Dr Vassiliki Bitsouni (ar hyn o bryd ym Mhrifysgol Athen)

Goruchwyliaeth gyfredol

Abhishek Chakraborty

Timothy Ostler

Neha Bansal

Myfyriwr Ymchwil/Tiwtor Graddedig