Dr Jacob Pattem
BSc (Hons), MRes, PhD
Bioddeunyddiau Darlithydd
- Ar gael fel goruchwyliwr ôl-raddedig
Trosolwyg
Rwy'n wyddonydd bioffisegol amlddisgyblaethol y mae ei ymchwil yn gorwedd ar ryngwyneb ffiseg, bioleg micro-i-foleciwlaidd, a nanodechnoleg. Rwy'n datblygu ac yn cymhwyso dulliau microsgopeg cydberthynol aml-ddimensiwn datblygedig (X, Y, Z delweddu, grym ac amser), gan ddatgelu cysylltiadau strwythur-swyddogaeth mewn iechyd a chlefydau dynol, anifeiliaid a phlanhigion. Rwyf wedi datblygu nifer o ddulliau dadansoddi mecanyddol nano a gydnabyddir yn rhyngwladol, arloesol ac uchel mewn microsgopeg grym bio-atomig (BioAFM).
Mae fy ymchwil yn canolbwyntio ar fecanweithiau gwybodus moleciwlaidd sy'n sail i ymatebion bioffisegol i brosesau biolegol cymhleth fel erydiad deintyddol, ailfwyneiddio, gwladychu microbaidd un a chell mult, rheoli bioffilm llafar, modiwleiddio rhwystr mwcws llafar a gastroberfeddol, dewisiadau amgen i wrth-ficrobau, haint a biosensio.
Fy nod yw pontio'r bylchau rhwng bioleg micro a moleciwlaidd, bio, cemeg organig ac anorganig, ffiseg polymer, nanometroleg, ac ymchwil gwyddoniaeth gyfrifiadurol i ddatrys cwestiynau ymchwil biolegol cymhleth. Rwyf bob amser yn anelu at gynnal ymchwil gyda'r nod o gyfieithu clinigol er budd cleifion, yn arbennig, y rhai sy'n dioddef o gyflyrau iechyd gwanychol a 3ydd cymunedau gwledig y byd sydd â mynediad gwael ac amharodrwydd i driniaeth.
Cyhoeddiad
2023
- Abu Hammad, K. et al. 2023. Comparative sedimentation equilibrium analysis of two IgG1 glycoforms: IgGCri and IgGWid. European Biophysics Journal 52(4-5), pp. 439-443. (10.1007/s00249-023-01656-x)
- Chun, T., Pattem, J., Gillis, R. B., Dinu, V. T., Yakubov, G. E., Corfeld, A. P. and Harding, S. E. 2023. Comparative hydrodynamic and nanoscale imaging study on the interactions of teicoplanin-A2 and bovine submaxillary mucin as a model ocular mucin. Scientific Reports 13, article number: 11367. (10.1038/s41598-023-38036-6)
- Chun, T., Pattem, J., Gillis, R. B., Dinu, V. T., Yakubov, G. E., Corfeld, A. P. and Harding, S. E. 2023. Self-association of the glycopeptide antibiotic teicoplanin A2 in aqueous solution studied by molecular hydrodynamics. Scientific Reports 13(1), article number: 1969. (10.1038/s41598-023-28740-8)
2022
- Pattem, J., Field, J., Waterhouse, P. J. and German, M. J. 2022. The dynamic interplay of dietary acid pH and concentration during early-stage human enamel and dentine erosion. Frontiers in Dental Medicine 3, article number: 1040565. (10.3389/fdmed.2022.1040565)
- Dinu, V. et al. 2022. Flavour compounds affect protein structure: the effect of methyl anthranilate on bovine serum albumin conformation. Food Chemistry 388, article number: 133013. (10.1016/j.foodchem.2022.133013)
- Riccardo, F. et al. 2022. Root angle is controlled by EGT1 in cereal crops employing an antigravitropic mechanism. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(31), article number: e2201350119. (10.1073/pnas.2201350119)
2021
- Pattem, J. et al. 2021. Dependency of hydration and growth conditions on the mechanical properties of oral biofilms. Scientific Reports 11, article number: 16234. (10.1038/s41598-021-95701-4)
- Pattem, J., Swift, T., Rimmer, S., Holmes, T., MacNeil, S. and Shepherd, J. 2021. Development of a novel micro-bead force spectroscopy approach to measure the ability of a thermo-active polymer to remove bacteria from a corneal model. Scientific Reports 11, article number: 13697. (10.1038/s41598-021-93172-1)
2018
- Pattem, J., Davrandi, M., Aguayo, S., Allen, E., Spratt, D. and Bozec, L. 2018. A multi-scale biophysical approach to develop structure-property relationships in Oral Biofilms. Scientific Reports 8(1), article number: 5691. (10.1038/s41598-018-23798-1)
Erthyglau
- Abu Hammad, K. et al. 2023. Comparative sedimentation equilibrium analysis of two IgG1 glycoforms: IgGCri and IgGWid. European Biophysics Journal 52(4-5), pp. 439-443. (10.1007/s00249-023-01656-x)
- Chun, T., Pattem, J., Gillis, R. B., Dinu, V. T., Yakubov, G. E., Corfeld, A. P. and Harding, S. E. 2023. Comparative hydrodynamic and nanoscale imaging study on the interactions of teicoplanin-A2 and bovine submaxillary mucin as a model ocular mucin. Scientific Reports 13, article number: 11367. (10.1038/s41598-023-38036-6)
- Chun, T., Pattem, J., Gillis, R. B., Dinu, V. T., Yakubov, G. E., Corfeld, A. P. and Harding, S. E. 2023. Self-association of the glycopeptide antibiotic teicoplanin A2 in aqueous solution studied by molecular hydrodynamics. Scientific Reports 13(1), article number: 1969. (10.1038/s41598-023-28740-8)
- Pattem, J., Field, J., Waterhouse, P. J. and German, M. J. 2022. The dynamic interplay of dietary acid pH and concentration during early-stage human enamel and dentine erosion. Frontiers in Dental Medicine 3, article number: 1040565. (10.3389/fdmed.2022.1040565)
- Dinu, V. et al. 2022. Flavour compounds affect protein structure: the effect of methyl anthranilate on bovine serum albumin conformation. Food Chemistry 388, article number: 133013. (10.1016/j.foodchem.2022.133013)
- Riccardo, F. et al. 2022. Root angle is controlled by EGT1 in cereal crops employing an antigravitropic mechanism. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(31), article number: e2201350119. (10.1073/pnas.2201350119)
- Pattem, J. et al. 2021. Dependency of hydration and growth conditions on the mechanical properties of oral biofilms. Scientific Reports 11, article number: 16234. (10.1038/s41598-021-95701-4)
- Pattem, J., Swift, T., Rimmer, S., Holmes, T., MacNeil, S. and Shepherd, J. 2021. Development of a novel micro-bead force spectroscopy approach to measure the ability of a thermo-active polymer to remove bacteria from a corneal model. Scientific Reports 11, article number: 13697. (10.1038/s41598-021-93172-1)
- Pattem, J., Davrandi, M., Aguayo, S., Allen, E., Spratt, D. and Bozec, L. 2018. A multi-scale biophysical approach to develop structure-property relationships in Oral Biofilms. Scientific Reports 8(1), article number: 5691. (10.1038/s41598-018-23798-1)
Addysgu
- MSc Peirianneg Meinwe ac Arweinydd Modiwl Meddygaeth Adfywiol: "Peirianneg Meinwe - o'r cysyniad i ymarfer clinigol"
Bywgraffiad
Trosolwg Gyrfa
- 2023 - Yn bresennol: Darlithydd mewn Biomaterials - Ysgol Deintyddiaeth Caerdydd
- 2020 - 2023: Cymrawd Ymchwil BBSRC - Prifysgol Nottingham, Biomaterials Mater Meddal a Biorhyngwynebau, Canolfan Genedlaethol Hydrodynameg Moleciwlaidd, Gwyddoniaeth Bwyd: Amddiffyn bioffisegol yn y perfedd mamaliaid: Datgloi mecanweithiau moleciwlaidd rhyngweithio ffibr dietegol â glycoproteinau mwcsin.
- 2019 - 2020: Uwch Wyddonydd Ceisiadau - CN Technical Services Ltd, UK: Bio-AFM a bioargraffu 3D
- 2018 - 2019: 1) Cydymaith Ymchwil Ôl-ddoethurol - Prifysgol Sheffield, Ysgol Deintyddiaeth Glinigol. Cyngor Ymchwil Medcial: Datblygu dulliau nano-fecanyddol i asesu ymyriadau nad ydynt yn AMR wrth Atal Keratits Microbaidd, in-vitro. 2) Cyswllt Ymchwil Ôl-Ddoethurol - Prifysgol Sheffield, Ysgol Deintyddiaeth Glinigol. Cronfa Ymchwil Challeneges Byd-eang a Chyfrif Cyflymu Effaith Byd-eang: Datblygu dyfais hawdd ei defnyddio cost isel ar gyfer canfod heintiau llygad ffwngaidd yng nghefn gwlad India.
- 2016 - 2018: Ymgynghorydd Ymchwil Ôl-ddoethurol a Chyswllt Ymchwil er Anrhydedd - Coleg Prifysgol Llundain, Sefydliad Deintyddol Eastman, Biomaterials a Pheirianneg Meinweoedd. Gwobr Ymchwil Ôl-ddoethurol BBSRC a Procter & Gamble: Datblygu system throuput uchel ar gyfer cynhyrchu, microsbioleg a dadansoddi eiddo nano-fecanyddol o amrywiol bioffilmiau llafar.
- 2015 - 2016: Cyswllt Ymchwil Ôl-ddoethurol - Canolfan Ymchwil Iechyd y Geg Prifysgol Newcastle. Ysgol Ddeintyddol Newcastle Bradlaw Gwobr Ôl-ddoethurol. 1) Dadansoddiad nanoraddfa o effaith asidau ar enamel dynol ac erydiad y dentin ac effaith ïonau metelaidd ar ei atal: astudiaeth delweddu meintiol AFM. 2) Dadansoddiad nanoraddfa o effaith asidau ar erydiad molar llygoden ac effaith hypodontia a ysgogir: Astudiaeth delweddu meintiol AFM in-vitro .
Addysg a Chymwysterau
- 2011 - 2014: Doethur mewn Athroniaeth (Ph.D) yn y Gwyddorau Deintyddol a Phatholeg Cellog, Canolfan Ymchwil Iechyd y Geg Prifysgol Newcastle, Deunyddiau Deintyddol / Gwobr ACHOS BBSRC gyda GlaxoSmithKline. Effaith pH asid dietegol a chanolbwyntio ar briodweddau nano-morffolegol a -mecanyddol enamel dynol a dentine in-vitro.
- 2009 - 2010: Meistr Ymchwil mewn Biowyddorau Meddygol a Moleciwlaidd (M.Res Merit), Canolfan Ymchwil Iechyd y Geg Prifysgol Newcastle, Deunyddiau Deintyddol.
- 2006 - 2009: Bacherlors Gwyddoniaeth mewn Nanotechnoleg (B.Sc Anrh, 2.1), Prifysgol Leeds, Systemau Moleciwlaidd Hunan-drefnu (SOMS)
Anrhydeddau a dyfarniadau
- 2018 - Gwobr Perfomance Ymchwil Procter & Gamble
- 2017 - Cymdeithas Ymchwil Ddeintyddol Internation (IADR) - Gwobr Ymchwil Carioleg
- 2015 - Gwobr Grŵp Meinwe Mwynol GSK (GSKMINTIG) GSK
- 2011 - Institue Deunyddiau, Mwynau a Mwyngloddio (IOM3) Cystadleuaeth Darlith Pobl Ifanc Ranbarthol WInner
Aelodaethau proffesiynol
- Aelod o'r Gymdeithas Ryngwladol ar gyfer Ymchwil Ddeintyddol/Cymdeithas Brydeinig ar gyfer Ymchwil Llafar a Deintyddol.
Ymrwymiadau siarad cyhoeddus
- 2022 - 2023: "Ailgynllunio Pensaernïaeth Gwreiddiau ar gyfer Gwydnwch Hinsawdd". Institue Ffiseg, Ffiseg am Oes 2023, Harrogate, UK
Pwyllgorau ac adolygu
- Pencampwr Gyrfa Cynnar Cymdeithas Microsgopeg Frenhinol Sganio Microsgopeg Probe Microsgopeg ac Adran Microsgopeg Atomig
- Adolygydd ar gyfer Archifau Bioleg Lafar
- Adolygydd ar gyfer Deunyddiau Gofal Iechyd Uwch
- Adolygydd ar gyfer Langmuir
- Adolygydd ar gyfer Adroddiadau Gwyddonol Natur
Meysydd goruchwyliaeth
Yn agored i dderbyn ceisiadau PhD gan:
Cyngor Ysgoloriaethau Tsieina (CSC) mewn meysydd sy'n ymwneud â:
-
- nanomecaneg bioffilm o dan amodau iach a chlefydedig
- Sbectrosgopeg grym celloedd sengl (cell facterol - rhyngweithio wyneb ar fewnblaniadau, haenau a sgaffaldiau meinwe)
- Nodweddu ecsopolysacarid o fioffilmiau'n hysbysu nanomecaneg
- Liposome-Cargo Nanomechanics
- Nanomecaneg liposome - rhyngweithiadau bioffilm ar arwynebau clinigol a gwrthficrobaidd topograffig gwahanol
- Rheoli priodweddau matrics bioffilm i gyflenwi gwrthficrobaidd enahnce
- Dulliau microsgopeg grym atomig newydd wrth nodweddu haint a chlefydau
- Mae'r meysydd cyffredinol eraill sy'n cael eu hystyried yn cynnwys:
- Iechyd y geg
- Gwella clwyfau
- Bioryngwynebau a diogelu rhwystrau
Mae Prifysgol Caerdydd yn cynnig ysgoloriaethau ffioedd dysgu i fyfyrwyr llwyddiannus Cyngor Ysgoloriaethau Tsieina nad ydynt wedi cofrestru ar hyn o bryd mewn rhaglen PhD. Dylid gwneud ceisiadau yn unol â chanllawiau CSC. Ymgeisiwch yma Ffurflen gais PhD Prifysgol Caerdydd. Gwnewch gais i Brifysgol Caerdydd erbyn 30 Tachwedd 2023 i astudio ar gyfer eich PhD dewisol, yn ddelfrydol ar gyfer dechrau ym mis Hydref 2024 .
Contact Details
Ysbyty Deintyddol y Brifysgol, Llawr 5, Ystafell 5F.03, Parc y Mynydd Bychan, Caerdydd, CF14 4XY
Themâu ymchwil
Arbenigeddau
- Microsgopeg a Sbectrosgopeg Grym Bioatomig
- Delweddu biofeddygol
- Ceisiadau mewn gwyddorau bywyd
- Peirianneg meinwe
- Meddygaeth adfywiol